KFU Extreme Biology Lab och RIKEN har avslöjat nya fakta om kycklingembryotillväxt, vilket kan leda till liknande upptäckter om människor. Verket publiceras i PLOS Biologi .

Ruslan Devyatiyarov, junior forskarassistent vid KFU Extreme Biology Lab, sa, "De erhållna resultaten presenteras för närvarande som en organiserad databas över promotorer i kycklingembryon i olika utvecklingsstadier, och den publicerade forskningen är källdokumentet som innehåller anteckningen och beskrivningen av de grundläggande egenskaperna hos dessa promotorer och aktiviteten hos de gener som är knutna till dem."

"CAGE-metoden används ofta i FANTOM-projektet för att bestämma startpunkten för gentranskription. CAGE har redan hjälpt till att identifiera promotorer för specifika vävnader och celler hos människor, möss, drosophila och andra modellorganismer.

"Det är omöjligt att testa mänskliga embryon på grund av etiska riktlinjer. Det är därför som projektet saknade data om embryonal utveckling. Vi tror att den närmaste organism som passar ersättningsrollen är tamhöna eftersom det är en fostervattenorganism med en relativt konservativ utveckling.

"Vi använde biologiska prover från ögonblicket av äggläggning till ögonblicket av kläckning, beredde sedan CAGE-bibliotek och sekvenserade dem. Således, vi skapade en fullständig genomannotering av punkterna för transkriptionsinitiering vid olika stadier av kycklingembryogenes. Vidare, vi lade till en del data om specifika vävnader och celler, nämligen, hepatocyter, celler i aortala muskler, mesenkym, ben och vingar under deras uppkomst på den tredje dagen av embryonal utveckling. Våra transkriptomiska data kan användas för att jämföra utvecklingen av promotorer för att bestämma viktiga transkriptionsfaktorer, gener eller deras isoformer som bidrar till vävnadsbildning."

FANTOM är mest engagerat i forskning om däggdjur, och kycklingar är inte dess huvudfokus. Dock, efter detta lyckade prov, forskarna beslutade att fortsätta med forskningen. Lagets huvudsakliga intresse, på grund av dess fokus på extrema förhållanden, är koncentrerad på kycklingembryonas förmåga att avbryta tillväxten vid sänkta temperaturer. Denna vilolägesförmåga har ännu inte studerats noggrant, och det lovar några intressanta praktiska konsekvenser.

"När en höna lämnar sin bädd, embryon slutar utvecklas tills temperaturen når normen. Det är, när ägg kyls till 16 grader, de går in i viloläge. Hibernation hos kycklingar, självklart, är inte så extrem som anhydrobios, men denna process kan vara lättare att anpassa sig till mänskliga vävnader och celler. Således, att fastställa nyckelmolekylära komponenter i regleringen av denna process är vårt nästa steg", tillade herr Devyatiyarov.

Databasen är tillgänglig online på http://fantom.gsc.riken.jp/zenbu/