Ett UC -forskargrupp har landat på en förutsägbar modell för HDL. Kredit:University of Cincinnati
Efter årtionden av individuella försök att identifiera strukturen för huvudbyggnaden för HDL (högdensitetslipoproteiner), det så kallade "goda" kolesterolet som associeras med skydd mot hjärt-kärlsjukdom, ett forskargrupp som representerar åtta akademiska institutioner i USA och Australien har kommit överens om en förutsägande modell.
Deras studie, "A Consensus Model of Human Apolipoprotein A-I in its Monomeric and Lipid-Free State" är för närvarande tillgänglig online i tidskriften Naturstruktur och molekylärbiologi .
"Vi är glada över att äntligen få en robust bild av hur detta protein ser ut, "säger Sean Davidson, Doktorsexamen, professor och vice ordförande vid Institutionen för patologi och laboratoriemedicin vid University of Cincinnati (UC) College of Medicine, och motsvarande författare om studien.
Davidson och John Melchior, Doktorsexamen, en postdoktor vid UC, organiserade en arbetsgrupp av ledande lipidstrukturbiologer för att attackera en grundläggande fråga inom fettmetabolism. "Alla vi, inklusive mig, har chippat bort vid kanterna av detta problem i årtionden, "säger Davidson, tillägger att proteinet helt enkelt inte svarar på de typiska metoderna som används för att modellera andra proteinstrukturer.
Således, arbetsgruppen tog ett nytt tillvägagångssätt:de kombinerade data från en mängd indirekta experimentella tekniker från olika laboratorier för att utveckla en konsensusmodell. Genombrottet tog över ett år av intensivt samarbete mellan forskare som normalt sett är i vänskaplig konkurrens. "Denna studie var en unik samarbetsupplevelse för mig. Människor från hela USA och Australien delade fritt vad som motsvarar ett par århundraden (eller mer) av kollektiv expertis och kunskap för att komma med en definitiv inblick i apoA-I-strukturen. " säger Kerry Anne-Rye, Doktorsexamen, en medförfattare från University of New South Wales i Australien.
En andra faktor, lågdensitetslipoprotein (LDL), har kallats "dåligt" kolesterol och kan vara skadligt. Medan kroppen behöver lite kolesterol för att fungera, när nivåerna av LDL blir för höga, fettavlagringar kan ackumuleras i blodkärlen. Detta får dem att minska, som leder till hjärtinfarkt, stroke eller andra allvarliga kärlproblem. HDL antas fungera mot denna ackumulering.
Förankrad av arbete som tilldelades Nobelpriset 1985, metabolismen av LDL är väl förstådd. Detta stimulerade utvecklingen av en klass av läkemedel som kallas statiner som minskar "dåligt" kolesterol. Dock, biologin för HDL har varit mer svårfångad och detta har komplicerat utvecklingen av HDL -riktade läkemedel, säger Davidson. "Vårt arbete, kombinerat med strukturen för ett kritiskt cellprotein som hjälper till att montera HDL som publicerades tidigare i år, ger oss äntligen verktygen att föreslå och testa hypoteser om hur HDL genereras. "