Mikrofotografierna av den elektronmikroskopiska analysen gjord av Dr Urska Repnik vid Kiel University Central Microscopy Facility visar en av de nyupptäckta bakterierna (A) som en hel bakterie som illustrerar formen och storleken och (B) som ett tvärsnitt som indikerar ultrastrukturen av cellhöljet. Kredit:Dr Urska Repnik, Central Microscopy Facility, Kiel University
Oavsett om det är växt, djur eller människa, är levande organismer koloniserade av en mängd bakterier. Forskningsrön de senaste åren visar att bakterier inte bara samexisterar med sin värd, utan bildar ömsesidiga interaktioner i form av en symbios som kan gynna både bakterien och värden.
Summan av en värd och dess associerade mikrober i sin helhet kallas av forskare som en metaorganism. Forskare från Kiel University och Max Planck Institute for Evolutionary Biology i Plön (MPI-EB) studerar sin evolutionära historia och funktion.
Bacteroides-bakterier förekommer i stort antal i mikrobiotan hos däggdjur och även hos människor. Med de två nyligen upptäckta stammarna, som isolerades från blindtarmen från vilda husmöss i djuranläggningen i MPI-EB, hoppas nu forskargruppen Evolutionary Medicine få nya insikter.
"Ett mål med den här upptäckten är att på sikt bättre förstå varför bakterier lever i och på oss. Många av dessa bakterier är fortfarande okända. Vi har nu samlat på oss mycket grundläggande kunskap om den här typen av bakterier och vet till exempel från mikroskopiska bilder hur dessa bakterier ser ut och vilken storlek de är", säger Dr Daniel Unterweger, forskargruppsledare vid MPI for Evolutionary Biology och Kiel University.
Upptäckten kom oväntat. För att bestämma identiteten på nyligen isolerade bakterier används moderna sekvenseringsmetoder för att avkoda bakteriegenomet och matcha det med kända bakteriearter. "Det var en stor överraskning att bakterierna vi isolerade inte matchade någon känd bakterieart i databasen och därför inte hade något namn ännu", säger första författaren Dr. Hanna Fokt, postdoktor vid MPI-EB, som beskriver den speciella ögonblick då det stod klart att hon hade upptäckt en ny bakterieart.
Resultaten av efterföljande genomiska och fenotypiska analyser tyder på att de två stammarna som beskrivs här representerar en ny art av släktet Bacteroides. Det är möjligt att dessa nya bakteriestammar kan finnas inte bara i möss utan även i andra däggdjur och därför lovar en bättre förståelse av utvecklingen av släktet Bacteroides som en viktig medlem av en frisk däggdjursmikrobiota. Sammansättningen av denna mikrobiota och dess interaktioner med värdceller är i fokus för forskningsintresset.
Den första bakteriearten som tillhörde Bacteroides beskrevs i slutet av 1800-talet och fick namnet Bacteroides fragilis. Sedan dess har totalt 35 olika Bacteroides-arter isolerats, karakteriserats och validerats. Förbättrade tekniska möjligheter för genomsekvensering idag gör det möjligt att bestämma bakteriers förhållande mycket exakt. Kulturer av bakteriearterna lagras i den tyska samlingen av mikroorganismer och cellkulturer i bland annat Braunschweig och är därmed tillgängliga för forskare över hela världen.
Forskningen publicerades i Archives of Microbiology . + Utforska vidare
