Strukturen för dubbelsträngat DNA är universellt i alla levande celler, men skillnader uppstår i metoderna för extraktion av genomiskt DNA från djur- och växtceller. Fastän genomiskt DNA lever i cellens kärna beror mängden och renheten hos extraherat DNA på cellens typ och storlek. Exempelvis innehåller vissa celler mer DNA och föroreningar än andra. Läs vidare för att lära dig mer om DNA-utvinningsskillnader.

Om du behandlar växt- och djurceller med en tvålämne, kommer det att försämra lipiderna i cellen och kärnmembranen. Därefter separerar DNA-blandningen från cellmembranen och proteinerna. Därefter kan du använda alkohol för att fälla ut DNA i lösningen. Beroende på mängden i provet kan DNA vara synligt med blotta ögat. Men kom ihåg att det här enkla förfarandet inte nödvändigtvis ger upphov till DNA med hög renhet.

Växt- och djurceller

Planta celler skiljer sig från djurceller på grund av deras styva cellvägg och organeller som kloroplasten. De innehåller också proteiner och enzymer som spelar en roll vid fotosyntesen. Vissa växtceller har polyploidi, vilket betyder att de har mer än en kopia av varje kromosom per cell. Dessutom producerar cellulära processer som förekommer i växter som fotosyntes en rad sekundära metaboliter. Djurceller har ingen cellvägg, men behöver fortfarande kemikalier som natriumdodecylsulfat (SDS) för att störa cellmembranet för att släppa genomiskt DNA.

Plant DNA-extraktion

Växthus DNA är mer svårt att extrahera på grund av växtens cellvägg. Du kan ta bort det genom homogenisering eller genom att lägga till cellulas för att degradera cellulosa som utgör cellväggen. Dessutom kan de metaboliter som finns i växtcellen interferera med genomisk DNA-extraktion genom att kontaminera DNA-provet under utfällningsprocessen.

Animal DNA-extraktion

Perifera blodleukocyter är huvudkällan för djur genomiskt DNA, men provsamlingen är svår eftersom blodet måste komma direkt från djuret. Blod innehåller en rad föreningar som proteiner, lipider, vita blodkroppar, röda blodkroppar, blodplättar och plasma, vilket kan kontaminera DNA-provet. Den primära föroreningen av animaliskt DNA som extraheras från blodprover är emellertid, vilket är den icke-proteinkomponenten i hemoglobin.

DNA-skillnaderna

Skillnaderna mellan DNA-växt och djur ligger i sekvensen av baser i spiralen. Föreningar som finns i växtceller är frånvarande i djurceller, och DNA-bassekvenserna reflekterar detta. Det genomiska växt-DNA är också ofta större än djur-DNA. Dessa skillnader påverkar också extraktionsmetoder, utbyte och renheten hos DNA.