Forskare från Karolinska Institutet har tillsammans med Pixelgen Technologies utvecklat och tillämpat en teknik som gör det möjligt att kartlägga proteiner i enskilda celler på ett helt nytt sätt. Nu är det inte bara möjligt att mäta mängden proteiner, utan också hur de är fördelade i cellens membran och hur de interagerar med varandra.
Tidigare kunde forskare endast studera ett begränsat antal proteiner i enskilda celler med hjälp av så kallad flödescytometri. Men den nya tekniken, kallad molekylär pixelering, går ett steg längre. Det är nu möjligt att analysera hundratals proteiner samtidigt och få en mer detaljerad bild av deras fördelning och interaktioner i enskilda celler. Detta är viktigt eftersom proteiner spelar en avgörande roll i cellulär funktion och signalering.
Resultaten publiceras i tidskriften Nature Methods .
"Genom att förstå hur proteiner beter sig i enskilda celler kan vi bättre studera sjukdomar som cancer och inflammatoriska sjukdomar. Dessutom kan vi använda tekniken för att utvärdera nya läkemedel och deras inverkan på fördelningen av proteiner i celler", säger en av de författare till studien, Petter Brodin, professor vid institutionen för kvinnors och barns hälsa, Karolinska Institutet.
"Ingen annan har tidigare rapporterat en liknande teknik, varför detta är så unikt", säger Brodin.
Nästa steg är att använda molekylär pixelering i forskning om cancer, immunförsvar och andra processer där proteinfördelningen förändras över tid, enligt Petter Brodin.
"Det här är spännande eftersom det kommer att öppna upp helt nya möjligheter inom encellsanalys och bidra till vår förståelse av biologiska processer", säger Brodin.
Mer information: Filip Karlsson et al, Molecular pixelation:spatial proteomics of single cells by sequencing, Nature Methods (2024). DOI:10.1038/s41592-024-02268-9
Journalinformation: Naturmetoder
Tillhandahålls av Karolinska Institutet
