En ny atlas över hur antikroppar attackerar spikproteinet i SARS-CoV-2, viruset som orsakar COVID-19, kan hjälpa forskare att designa effektivare vacciner och behandlingar.
Atlasen, publicerad i tidskriften Nature, är baserad på data från över 1 000 antikroppspikproteinkristallstrukturer. Den visar hur olika antikroppar binder till olika delar av spikeproteinet, och hur dessa interaktioner kan påverka virusets förmåga att infektera celler.
"Denna atlas ger en heltäckande bild av hur antikroppar känner igen spikproteinet i SARS-CoV-2", säger studiens medförfattare Jason McLellan, en strukturbiolog vid University of Texas i Austin. "Denna information kan användas för att designa vacciner och behandlingar som är mer effektiva mot viruset."
Spikproteinet är en viktig del av SARS-CoV-2, och det är målet för de flesta vacciner och behandlingar som för närvarande utvecklas. Proteinet är lokaliserat på virusets yta, och det är ansvarigt för att binda till celler och låta viruset komma in.
Antikroppar är proteiner som produceras av immunsystemet som svar på infektion. De kan binda till virus och hindra dem från att infektera celler.
Den nya atlasen visar att antikroppar kan binda till olika delar av spikeproteinet, inklusive den receptorbindande domänen (RBD). RBD är den del av spikeproteinet som binder till celler, och det är ett nyckelmål för vacciner och behandlingar.
Atlasen visar också att vissa antikroppar kan binda till flera delar av spikeproteinet, vilket kan göra dem mer effektiva för att förhindra infektion.
"Dessa fynd kan hjälpa oss att designa mer effektiva vacciner och behandlingar mot SARS-CoV-2", säger McLellan. "Genom att rikta in oss på de mest sårbara delarna av spikeproteinet kan vi utveckla terapier som kan blockera viruset från att infektera celler."
Den nya atlasen är en värdefull resurs för forskare som arbetar med att utveckla vacciner och behandlingar mot covid-19. Det ger en heltäckande bild av hur antikroppar interagerar med spikeproteinet, och det kan hjälpa till att påskynda utvecklingen av nya terapier.