Det finns två huvudtyper av riboswitchar:transkriptionella riboswitchar och translationella riboswitchar. Transkriptionella riboswitchar reglerar genuttryck genom att kontrollera transkriptionen av nedströmsgenen. Translationella riboswitchar reglerar genuttryck genom att kontrollera translationen av nedströmsgenen.
I bakterier är riboswitch involverade i en mängd olika cellulära processer, inklusive metabolism, transport och virulens. Till exempel reglerar riboswitchen tiaminpyrofosfat (TPP) uttrycket av gener som är involverade i tiaminbiosyntesen i bakterier. TPP-riboswitchen binder till TPP, vilket orsakar en konformationsförändring som hämmar uttrycket av nedströmsgenerna.
Riboswitchar är väsentliga för bakteriers överlevnad och spelar en nyckelroll för att reglera genuttryck som svar på förändringar i miljön. De är potentiella mål för utvecklingen av nya antimikrobiella läkemedel.
Här är en mer detaljerad förklaring av hur molekylära riboswitchar fungerar i bakterier:
Transkriptionella riboswitchar:
1. Riboswitchen är belägen i 5' UTR av mRNA.
2. Riboswitchen består av en aptamerdomän och en expressionsplattform.
3. Aptamerdomänen binder till en specifik ligand.
4. Bindningen av liganden orsakar en konformationsförändring i riboswitchen.
5. Konformationsförändringen i riboswitchen modulerar uttrycket av nedströmsgenen.
Translationella riboswitchar:
1. Riboswitchen är belägen i 5' UTR av mRNA.
2. Riboswitchen består av en aptamerdomän och en expressionsplattform.
3. Aptamerdomänen binder till en specifik ligand.
4. Bindningen av liganden orsakar en konformationsförändring i riboswitchen.
5. Konformationsförändringen i riboswitchen modulerar translationen av nedströmsgenen.
Riboswitchar är väsentliga för bakteriers överlevnad och spelar en nyckelroll för att reglera genuttryck som svar på förändringar i miljön. De är potentiella mål för utvecklingen av nya antimikrobiella läkemedel.