DNA kan inte direkt visualiseras med ett 400x mikroskop. Detta beror på att DNA-molekyler är för små för att kunna lösas upp med optiska mikroskop. Den typiska storleken på en DNA-molekyl är cirka 2 nanometer (nm) i diameter, medan upplösningsgränsen för ett 400x mikroskop är cirka 0,25 mikrometer (µm). Detta innebär att föremål mindre än 0,25 µm inte kan ses tydligt med ett 400x mikroskop.

För att visualisera DNA krävs speciella tekniker som elektronmikroskopi eller atomkraftsmikroskopi. Elektronmikroskop använder en elektronstråle istället för ljus, vilket möjliggör mycket högre upplösning. Atomkraftsmikroskop använder en vass sond för att skanna ytan på ett prov, vilket kan ge tredimensionella bilder av DNA-molekyler.