* Båda återspeglar en organismens genetiska smink: Genotyp representerar den faktiska genetiska koden, medan fenotyp är uttrycket för den koden. Båda påverkas slutligen av generna som en organisme ärver.
* båda kan påverkas av miljön: Medan genotyp är fixerad kan miljön spela en roll i att forma fenotyp. Till exempel kan en växt med gener för höghet växa kortare i en näringsmiljö.
* båda kan användas för att studera arv: Genom att observera fenotyper och deras motsvarande genotyper kan vi förstå hur egenskaper överförs från föräldrar till avkommor. Detta är grunden för genetikforskning.
* båda är viktiga för att förstå biologisk mångfald: Samspelet mellan genotyp och fenotyp är det som skapar det stora utbudet av organismer vi ser i världen.
I huvudsak är fenotyp "utgången" av genotyp, formad av miljön. Att förstå förhållandet mellan de två är avgörande för att förstå mekanismerna för ärftlighet och biologisk mångfald.