* Brist på en kärna: Både archaea och bakterier saknar en membranbunden kärna, som innehåller deras genetiska material (DNA).
* Enkel cellstruktur: Båda är encelliga organismer med relativt enkla inre strukturer jämfört med eukaryota celler.
* Storlek: Både archaea och bakterier är i allmänhet små i storlek, vanligtvis bara ett fåtal mikrometer i diameter.
* Liknande utseende under ett mikroskop: Under ett mikroskop verkar båda typerna av celler mycket lika och saknar de komplexa inre strukturerna som ses i eukaryoter.
Framsteg inom molekylärbiologi, särskilt analysen av ribosomalt RNA (rRNA), avslöjade emellertid signifikanta skillnader mellan archaea och bakterier. Dessa skillnader ledde till omklassificering av archaea som en separat livsdomän:
* Distinkta rRNA -sekvenser: Archaea har en unik rRNA -sekvens som skiljer sig väsentligt från bakterier, vilket indikerar en djupare evolutionär divergens.
* Olika cellväggens sammansättning: Cellväggarna i archaea består av olika molekyler än bakteriecellväggar.
* DISTANCE METABOLISKA VÄGAR: Archaea har unika metaboliska vägar som inte finns i bakterier, inklusive förmågan att trivas i extrema miljöer.
Detta molekylära bevis ledde i slutändan till det tre domänssystemet för klassificering, som skiljer liv i bakterier, archaea och eukarya.
