De första eukaryota cellerna förekommer i fossilrekordet runt 2,7 miljarder år sedan (BYA) . Dessa tidiga eukaryoter var troligen enkelcelliga organismer och representeras av fossiler av akriters , som är organiska murade mikrofossiler av osäker biologisk affinitet.

Det finns emellertid bevis som tyder på att eukaryoter kan ha utvecklats ännu tidigare, eventuellt runt 3,5 BYA . Detta bevis kommer från:

* biomarköranalys: Specifika molekyler som finns i forntida bergarter antyder förekomsten av eukaryota organismer redan före det första fossila beviset.

* genetisk analys: Jämförelser av genetiskt material mellan olika organismer indikerar ett mycket äldre ursprung för eukaryoter.

Därför, medan det första betongfossila beviset på eukaryota celler går tillbaka till 2,7 BYA , deras ursprung kan vara mycket tidigare, troligen mellan 3,5 och 2.7 BYA .