Euglena gracilis klassificeras inom phylum Euglenozoa Inom kungariket Protista. Här är en uppdelning av dess klassificering:

* domän: Eukary

* Kingdom: Protista

* phylum: Euglenozoa

* klass: Euglenophyceae

* Order: Euglenales

* Familj: Euglenaceae

* släktet: Euglena

* Arter: Euglena gracilis

Det är viktigt att notera att klassificeringen av organismer kan förändras när vetenskaplig förståelse utvecklas.