1665 publicerade han sina observationer i sin bok "Micrographia". Han använde ett mikroskop för att undersöka en tunn skiva kork och observerade små fack som han kallade "celler" eftersom de påminde honom om de små rummen som munkar bodde i.
Medan Hooke observerade döda celler, banade hans arbete vägen för utvecklingen av cellteori, som säger att alla levande organismer består av celler.