Taxonomi är den gren av biologi som handlar om klassificering, namngivning och identifiering av organismer. Linné utvecklade ett hierarkiskt system för klassificering av organismer, som fortfarande används idag, men med vissa modifieringar. Detta system är baserat på delade egenskaper och är organiserat i en serie kapslade grupper, från breda kategorier som kungarike ner till arter.

Linnés arbete var banbrytande och lägger grunden för det moderna taxonomifältet. Han krediteras också för att introducera binomial nomenklatur, systemet för att ge varje art ett tvådelat vetenskapligt namn, till exempel * homo sapiens * för människor.