1. fossil Record: Fossiler ger en direkt register över livet tidigare. De visar en utveckling av organismer över tid, med äldre fossiler i allmänhet enklare än nyare. Detta stöder idén om gradvis förändring och nedstigning med modifiering. Vidare visar övergångsfossiler (som Archeopteryx, som har funktioner hos både reptiler och fåglar) evolutionära kopplingar mellan olika grupper.
2. Jämförande anatomi: De anatomiska likheterna mellan olika arter tyder på vanliga förfäder. Till exempel är benstrukturen hos en mänsklig arm, en fladdermusvinge, en valflippare och ett hästben anmärkningsvärt lika, även om dessa strukturer tjänar olika funktioner. Detta förklaras av härkomst från en gemensam förfader med en liknande skelettstruktur.
3. DNA och molekylärbiologi: Den genetiska koden (DNA) är universell i alla livsformer, vilket antyder ett gemensamt ursprung. Att jämföra DNA -sekvenser mellan olika arter gör att vi kan rekonstruera evolutionära förhållanden och uppskatta hur nära besläktade arter är. Dessutom stöder närvaron av homologa gener (gener med liknande sekvenser i olika arter) ytterligare idén om delade förfäder och evolutionär förändring.