* Låg ATP avkastning: Jäsning producerar en mycket liten mängd ATP jämfört med aerob andning. Medan aerob andning ger cirka 36-38 ATP-molekyler per glukosmolekyl, producerar fermentering endast 2 ATP-molekyler .
* Ofullständig glukosnedbrytning: Fermentering bryter bara delvis ner glukos, vilket lämnar mycket potentiell energi outnyttjad. Detta gör att mycket av energin som lagras i glukos inte tas tillvara för ATP-produktion.
* Tillverkning av avfallsprodukter: Jäsning ger avfallsprodukter som mjölksyra (i djur) eller etanol (i jäst). Dessa biprodukter kan vara skadliga i höga koncentrationer och kan till och med bidra till muskeltrötthet vid ansamling av mjölksyra.
Sammantaget är fermentering ett mindre effektivt sätt att generera energi jämfört med aerob andning. Det är ett "backup"-system som gör att organismer kan överleva i frånvaro av syre.