Uppräkning är den exakta kvantifieringen av livsdugliga mikroorganismer i ett prov – ett viktigt verktyg för livsmedelssäkerhet, vattentestning och klinisk diagnostik. Medan mikrobervärlden sträcker sig från bakterier till virus, är målet detsamma:att bestämma hur många levande celler som finns.
Platträkning, även känd som metoden för livskraftig eller kolonibildande enhet (CFU), är guldstandarden för uppräkning. En serieutspädning av provet sprids på agarplattor, inkuberas och de resulterande kolonierna räknas. Genom att multiplicera koloniantalet med utspädningsfaktorn beräknas den ursprungliga CFU/mL eller CFU/g.
Även om ett plattantal inte avslöjar enskilda celler - eftersom en enskild koloni kan uppstå från en eller flera celler - ger det en mycket tillförlitlig uppskattning av den livskraftiga populationen. Tekniken är godkänd av ISO4833-1 och används i stor utsträckning i mikrobiologiska laboratorier över hela världen.
Mikroskopi erbjuder ett direkt sätt att räkna celler, oavsett livsduglighet. Ett prov delas upp i flera lika stora kammare och det genomsnittliga antalet celler per kammare bestäms under ett mikroskop. Detta medelvärde extrapoleras sedan till hela urvalet.
Den huvudsakliga begränsningen är att skilja levande från döda celler; färgningsmetoder (t.ex. LIVE/DEAD BacLight) kan förbättra noggrannheten men lägga till komplexitet.
I grumlighetsanalyser mäts grumligheten hos ett vätskeprov spektrofotometriskt. Den optiska densiteten korrelerar med celldensiteten, vilket möjliggör uppskattning av livskraftiga räkningar genom en standardkurva härledd från kända CFU-prover.
Noggrannheten beror på en väletablerad kalibreringskurva och på att hålla låga cellkoncentrationer för att undvika självskuggning. Jämförelser av visuell grumlighet används också, som matchar provets grumlighet mot en referens med känt antal.
Massbestämning innebär att man väger det biologiska materialet i ett prov och jämför det med en standardkurva med kända cellantal, vilket ger en uppskattad population.
Aktivitetsanalyser mäter metaboliska produkter – som CO₂, laktat eller ATP – som produceras av mikroberna. Genom att jämföra produktnivån med en kalibreringskurva kan antalet aktiva celler utläsas.
Varje uppräkningsmetod balanserar noggrannhet, hastighet och praktiska egenskaper. För kritiska tillämpningar ger en kombination av flera tekniker den mest robusta bedömningen av mikrobiell belastning.