Kredit:University of New Mexico
Jeremy Edwards, chef för Computational Genomics and Technology (CGaT) Laboratory vid University of New Mexico, och hans kollegor på Centrillion Technologies i Palo Alto, Kalifornien och West Virginia University, har utvecklat ett chip som ger en enklare och snabbare metod för genomsekvensering av virus som COVID-19.
Deras forskning, titeln "Highly Accurate Chip-Based Resequencing of SARS-CoV-2 Clinical Samples" publicerades nyligen i American Chemical Society's Langmuir . Som en del av forskningen, forskare skapade en belagd genom-array som de utvecklade för snabb och billig full viral genom-resekvensering och använde sin SARS-CoV-2-specifika genom-array för att snabbt och exakt sekvensera det virala genomet från åtta kliniska prov som förvärvats från patienter i Wyoming som testade positivt för SARS-CoV-2. I sista hand, de kunde sekvensera 95 procent av genomet av varje prov med mer än 99,9 procents noggrannhet.
"Denna nya teknik möjliggör snabbare och mer exakt spårning av COVID och andra luftvägsvirus, inklusive utseendet på nya varianter, sa Edwards, som är professor vid UNM Institutionen för kemi och kemisk biologi. "Med denna enkla och snabba testprocedur, forskare kommer att kunna spåra utvecklingen mer exakt och bättre förhindra uppkomsten av nästa pandemi."
SARS-CoV-2 helgenomsekvens. Kredit:University of New Mexico
Med mer än 142 miljoner människor världen över har smittats av viruset, vaksamma tester och kontaktspårning är de mest effektiva sätten att bromsa spridningen av covid-19. Traditionella metoder för kliniska tester ger ofta falska positiva eller negativa resultat, och traditionella metoder för sekvensering är tidskrävande och dyra. Denna nya teknik kommer praktiskt taget att eliminera alla dessa hinder.
"Sedan inlämnandet av uppsatsen, Tekniken har vidareutvecklats med förbättrad noggrannhet och känslighet, ", sade Edwards. "Chip-teknologin är den bästa tillgängliga teknologin för storskalig virusgenomövervakning och övervakning av virala varianter. Den här tekniken kunde inte bara hjälpa till att kontrollera denna pandemi och även förhindra framtida pandemier."
