Organismer som lever i miljöer som skulle skada eller döda de flesta saker kallas extremofiler. När den extrema miljön har ett mycket lågt pH, vanligen under tre, är de kända som acidofiler. Acidophilic bakterier lever på en mångfald av platser, från ventiler i botten av havet till termiska egenskaper i Yellowstone till magen, och alla har anpassningar för att överleva under svåra, sura förhållanden.

Helicobacter pylori

Helicobacter pylori är en bakterieart som finns i magen och ansvarar för 80-90 procent av magsåren (se referens 3). Den är formad som en skruv med flera flagella som hjälper den att röra sig. Människans mage kan ha ett pH så lågt som två, sura nog att denaturera proteiner, börja smälta din mat och döda de flesta bakterier. Helicobacter pylori är acidofil, men föredrar att inte spendera energi som håller sig säker från de skadliga effekterna av syra, så det spenderar mycket av sin tid som grävs djupt i magsmältningen. När den behöver flyttas från plats till plats isolerar den sig med en skyddande bubbla av buffertlösning som neutraliserar syran.

Thiobacillus acidophilus

Thiobacillus acidophilus är ett exempel på en termo-acidofil , vilket betyder en bakterie som gillar både extremt heta och extremt sura miljöer. Den finns i sura geyserbassänger i Yellowstone National Park, liksom andra platser. Det är också intressant eftersom det kan fotografera eller få sin energi från solen. Liksom de flesta acidofila bakterier överlever den genom att använda en mycket effektiv protonpump för att förhindra att många väteatomer kommer in och byter sitt interna pH.

Acetobacter aceti

De flesta acidofila bakterierna använder anpassningar för att hålla deras interna pH-neutrala så att syran inte denaturerar sina proteiner, men Acetobacter aceti har modifierat sina proteiner så att de inte skadas av sura miljöer. En studie i tillämpad miljömikrobiologi fann mer än 50 specialiserade proteiner som hade utvecklats för att hjälpa bakterien att hantera sura förhållanden. All denna anpassning är bra för människor, eftersom vi har använt denna art för att skapa ättiksyra eller ättika i tusentals år.

Oligotropha corboxydovorans

I djupa havet där inget ljus tränger in, termiska ventiler på havsbotten spyr sura och andra giftiga material. Dessa öppningar utgör grunden för ett otroligt ekosystem. En musslor som lever bland de termiska ventilationsluckorna har ett symbiotiskt förhållande med Oligotropha corboxydovorans. Musslan ger ett hem och bakterierna konsumerar väte för att skapa energi för båda. Väteatomer gör syrorna syra, och dessa bakterier har funnit ett sätt att använda väte och omvandla sig till miniatyrbränsleceller.