HPLC (högpresterande vätskekromatografi) och GC (gaskromatografi) är båda metoder som forskare använder för att analysera prover för att bestämma vad provet innehåller eller koncentrationen av molekyler i provet. Båda använder samma princip, att tyngre molekyler elueras eller flyter långsammare än lättare (polaritet spelar också en roll i elueringstiden). Även om idén är densamma, har GC och HPLC flera skillnader.
Mobilfasen

Den mobila fasen för kromatografisk utrustning är det ämne som förflyttar provet genom maskinen. I HPLC är den mobila fasen en vätska som består av ett organiskt lösningsmedel, ultrapure-vatten och andra ingredienser för att säkerställa dess kompatibilitet med provet. GC använder gas för sin mobila fas. Gaser som används inkluderar helium, kväve, argon eller väte, beroende på vad som analyseras.
Kolumnerna <<> När prover rör sig över kromatografikolonner samverkar provet och mobilfasen med kolonninnehållet vilket orsakar komponenterna i provet elueras vid olika tidpunkter. HPLC-kolumner är vanligtvis fyra till sex tum långa metall- eller glasrör tätt packade med kiseldioxid eller olika kolkedjelängder. GC-system har spiralformade kapillärpelare med innerväggar belagda med olika material beroende på labbets behov. Sträckta ut kan GC-kolumner nå längder 100 fot.
Proverna <<> GC används för flyktiga föreningar (de som bryts ned snabbt) medan HPLC är bättre för mindre flyktiga prover. Om ett prov innehåller salter eller har en laddning måste det analyseras med HPLC, inte GC.
Temperaturkontroll

GC-kolumner finns i en ugn i maskinen. En dator ändrar temperaturen medan prover analyseras. Ju högre temperatur, desto snabbare eluerar provet, men temperaturer som är för höga ger dåliga resultat. HPLC-kolumner hålls vid en stabil temperatur (oftast rumstemperatur) hela tiden.