DNA-metylering :DNA-metylering är en av de mest väl studerade epigenetiska modifieringarna. Det involverar tillägg av en metylgrupp till kol 5-positionen i cytosinnukleotider, ofta i samband med CpG-dinukleotider. DNA-metylering är vanligtvis associerad med gentystnad. Högmetylerade regioner, kända som CpG-öar, finns ofta i promotorregionerna av gener och kan förhindra bindning av transkriptionsfaktorer och andra regulatoriska proteiner, och därigenom hämma genuttryck.
Histonändringar :Histoner är proteiner som DNA sveper runt för att bilda kromatin, kromosomernas strukturella material. Olika kemiska modifieringar kan förekomma på histonsvansar, inklusive acetylering, metylering, fosforylering och ubiquitinering. Dessa modifieringar kan förändra strukturen och tillgängligheten av kromatin, vilket påverkar genuttrycket. Till exempel är histonacetylering i allmänhet associerad med genaktivering, medan histonmetylering kan ha kontextberoende effekter på genuttryck.
Icke-kodande RNA :Icke-kodande RNA (ncRNA) är RNA-molekyler som inte kodar för proteiner. Vissa typer av ncRNA, såsom mikroRNA (miRNA) och små störande RNA (siRNA), kan binda till specifika mRNA-molekyler och förhindra deras översättning till proteiner. Denna mekanism, känd som RNA-interferens (RNAi), spelar en roll vid tystnad av gener och reglering.
DNA-slingor och isolatorer :DNA-looping och bildandet av kromatinslingor kan föra avlägsna regulatoriska element, såsom förstärkare och ljuddämpare, i nära anslutning till genpromotorer. Isolatorer är DNA-sekvenser som blockerar interaktionen mellan förstärkare och promotorer, vilket förhindrar aktivering av gener. Dessa mekanismer kan bidra till gentystnad genom att skapa fysiska barriärer eller regulatoriska gränser.
Det är viktigt att notera att kemiska modifieringar på DNA ofta samverkar med andra regulatoriska faktorer och mekanismer för att uppnå exakt kontroll över genuttryck. Störningar eller onormala mönster i dessa modifieringar kan leda till genavreglering och bidra till olika sjukdomar, inklusive cancer och utvecklingsstörningar.