En molekyl med delvis laddade områden kallas en polär molekyl. En polär molekyl är en molekyl där elektronerna inte är jämnt fördelade, vilket resulterar i en separation av positiva och negativa laddningar. Detta kan inträffa när molekylen har olika elektronegativa atomer, vilket betyder att de har olika förmåga att attrahera elektroner. Den elektronegativa atomen attraherar elektroner starkare, vilket skapar en partiell negativ laddning på den atomen och en partiell positiv laddning på den andra atomen. Denna separation av laddningar skapar en dipol, som är en vektor som representerar storleken och riktningen för laddningsseparationen. Polära molekyler är viktiga i många kemiska och biologiska processer, såsom vätebindning och solvatisering.