Natriumhydroxid är en stark bas som kan öka pH i en lösning. Om natriumhydroxid tillsätts till en lösning av pepsinogen kommer det att höja pH och göra att pepsinogenet omvandlas till pepsin. Pepsinet kommer dock inte att vara aktivt i miljön med högt pH och kommer därför inte att kunna bryta ner proteiner.
Sammanfattningsvis har natriumhydroxid effekten att omvandla pepsinogen till pepsin, men pepsinet kommer inte att vara aktivt i den miljö med högt pH som skapas av natriumhydroxiden.