Dessutom kan enzymer också öka reaktionshastigheten genom att öka den effektiva koncentrationen av substratet. Detta uppnås genom att binda till substratet och hålla det i omedelbar närhet av det aktiva stället, som är den del av enzymet som katalyserar reaktionen. Genom att öka koncentrationen av substratet ökar enzymet sannolikheten för att substratet kolliderar med det aktiva stället och genomgår en reaktion.
Sammantaget påskyndar enzymer reaktionen av ett substrat genom att sänka aktiveringsenergin och öka den effektiva koncentrationen av substratet. Dessa effekter gör att reaktionen kan ske snabbare och mer effektivt, vilket leder till ökade reaktionshastigheter.