1. 2'-hydroxylgruppen:
* RNA: RNA har en hydroxylgrupp (OH) fäst vid 2 'kol i dess ribossocker. Denna hydroxylgrupp gör RNA mer mottaglig för hydrolys , en process där fosfodiesterbindningarna som förbinder nukleotider bryts ned med vatten. Under alkaliska förhållanden accelereras denna hydrolysreaktion.
* DNA: DNA saknar denna 2'-hydroxylgrupp, med bara en väteatom (H) vid den positionen på sitt deoxyribosocker. Detta gör DNA betydligt mer resistent mot hydrolys i alkaliska miljöer.
2. Basstruktur och nedbrytning:
* RNA: Närvaron av uracil (U) i RNA gör det benäget att deamination , där aminogruppen (-NH2) på uracil omvandlas till en karbonylgrupp (C =O). Detta konverterar uracil till cytosin (C), vilket potentiellt leder till mutationer. Även om deaminering kan hända med både RNA och DNA, är det vanligare i RNA på grund av närvaron av uracil.
* DNA: DNA innehåller tymin (T) istället för uracil. Tymin är mindre benägna att deamination än uracil, vilket bidrar till DNA:s större stabilitet.
3. Sekundära strukturer:
* RNA: RNA:s enkelsträngade natur gör att den kan bilda en mängd komplexa sekundära strukturer, inklusive hårnålslingor, stam-slingor och pseudoknots. Dessa strukturer kan vara ganska bräckliga och kan störas av alkaliska förhållanden, vilket ytterligare bidrar till RNA -nedbrytning.
* DNA: DNA:s dubbelsträngade struktur, med dess vätebindningar mellan komplementära baser, ger större stabilitet och resistens mot alkalisk störning.
Sammanfattningsvis:
Närvaron av 2'-hydroxylgruppen, den inneboende instabiliteten hos uracil och de mer komplexa och bräckliga sekundära strukturerna gör RNA mycket mer sårbara för nedbrytning under alkaliska förhållanden jämfört med DNA.
