Alla levande organismer håller sig i matkedjan, strukturerad kring överföringen av livsuppehållande energi genom ett ekosystem: från solljus till växt till kanin till bobcat till maggot, att göra ett enkelt exempel. Eftersom denna energiöverföring innebär att medlemmarna i livsmedelskedjan interagerar med varandra och deras miljö i ett komplext, interlocking ekologiskt system, kan utrotning av en art ha en kaskad effekt på andra.
Ökad befolkning av prey
När en rovdjur blir hotad eller utdöd, avlägsnar detta en kontroll och balans i livsmedelskedjan på rovbefolkning som tidigare förbrukats av den rovdjuren. Följaktligen kan bytesbefolkningen explodera. Till exempel berodde den enorma ökningen av vita-tailed hjortbefolkningar i det centrala och östra USA i senare hälften av 20-talet sannolikt delvis från reducerade eller helt eliminerade populationer av rådjur av rovdjur, nämligen vargar och pumor. Överbrowsing som ett resultat av sådana överdrivna rådjur kan omvandla smink av växtgemenskaper och negativt påverka skogsföryngring.
Rippleeffekt på andra arter
Utrotning eller utrotning av en art kan äventyra livskraften hos en annan art. I Storbritannien sjönk exempelvis den röda myrpopulationen som ett resultat av färre fårbete i betesmarker. får hade tidigare hållit gräset kort, den röda myrns habitatpreferens. I sin tur ledde rödmjölksmassan till utrotningen av en stor fjärilsart som äter röda ägg som en del av sin livscykel. Matkedjestörningar från förlusten av en enskild art kan också vara ekosystemövergripande: När havsöter minskar kan populationer av havsborrar, en föredragen ottermat, explodera. Den resulterande överbefolkningen av kelpmunching-urchiner kan under tiden minska kelpskogarna och hota många marina arter som är beroende av detta livsmiljö.
Minskad biologisk mångfald
Den totala ekosystemets instabilitet på grund av minskad biologisk mångfald ligger bland de konsekvenser av artutrotning. När antalet arter i en livsmedelskedja minskar finns färre hållbara alternativ för medlemmar i livsmedelskedjan som hade berodde på de utdöda arterna. Den biologiska mångfalden ger också en genetisk variation till en befolkning och hjälper till att anpassa sig till fluktuerade miljöförhållanden. Exempelvis föreslog en studie av tropiska regnskogar i Västafrika som genomfördes av ekologer vid Leeds University mellan 1990 och 2010 att biologisk mångfald mildrar effekterna av klimatförändringar och hjälper trädarterna att anpassa sig till torkförhållandena.
Förstörda livsmiljöer
Utrotning av djur- eller fågelarter i livsmedelskedjan kan också förändra den fysiska miljön. Till exempel utbröt olycklig introduktion av den roviga bruna trädens orm till Guam 10 av de 12 inhemska fågelarterna på ön vilket orsakade skador på skogen på skogen, enligt en studie från University of Washington. Biologer fann att utrotning av fåglarna hade negativt påverkat trädbestämning, frösprigning och fröspridning. Utan fåglar att sprida frön kan det bara finnas några klumpar av monotartade träd i Guams framtid, grunden för att förändra skogens livsmiljö.