Darwin själv lade fram två teorier. För det första antog han att sex kan vara fördelaktigt eftersom det möjliggör utrensning av skadliga mutationer. För det andra föreslog han att sex kan stimulera evolutionär förändring genom att ständigt blanda om de genetiska "korten".
Modern evolutionsteori stöder generellt den andra av Darwins idéer, den om sex som en motor för evolutionär förändring. Viktigt är att teoretiska modeller indikerar att sex endast kan främja evolutionär anpassning (dvs öka konditionen) om miljön och de tillhörande selektiva krafterna förändras.
För de flesta organismer fluktuerar miljöer kontinuerligt på grund av förändrade vädermönster, förändrad mattillgång, spridning av sjukdomar, invasion av konkurrenter och så vidare. Under sådana förhållanden hjälper rekombination och sex till att upprätthålla anpassning genom att producera nya genkombinationer. Viktigt, eftersom nya genkombinationer är osannolikt att vara skadliga och potentiellt fördelaktiga, har de flesta avkommor som produceras genom sexuell reproduktion en kondition som ligger nära föräldrarnas (ett faktum som kallas "Mullers spärr"). Denna robusthet tillåter befolkningar att överleva miljöförändringar och bestå på lång sikt.
Den långsiktiga fördelen med sex är upprätthållandet och utvecklingen av genetisk mångfald, vilket säkerställer arternas beständighet över geologiska tidsskalor.
