Vid första ögonkastet, jästen Candida krusei verkar lika ofarlig som mikrober kommer:den används för att jäsa kakaobönor och ger choklad dess behagliga arom. Men det upptäcks i allt högre grad som en patogen hos patienter med nedsatt immunförsvar – och C. krusei-infektioner är inte alltid lätta att bota. Denna jäst är naturligt resistent mot flukonazol, ett förstahandssvampmedel som är avgörande inte bara för att behandla många svampinfektioner utan också för att förebygga dem i känsliga populationer. I septembernumret av G3 , Cuomo et al. avslöja den första helgenomsekvensen av ett kliniskt prov av C. krusei, ger ledtrådar till gener som kan vara viktiga för artens flukonazolresistens.

Vissa utkast till sammansättningar av C. krusei-genomet hade tagits fram före dessa forskares arbete, men de var splittrade, ett problem som orsakas av en stor mängd heterozygositet. Nyckeln till deras framgång var att generera långa sekvensläsningar, producerar en samling med inte många fler ställningar än C. krusei har kromosomer.

Med sitt nya utkast i handen, Brand et al. sökte i C. kruseigenome efter gener som är associerade med patogenes i de mer välbekanta Candida albicans - orsaken till trast, vaginal svampinfektion, och ibland potentiellt dödliga systemiska infektioner. C. krusei, de hittade, har få kopior av genfamiljer associerade med patogenes hos C. albicans, inklusive oligopeptidtransportörer, aspartylproteaser, och fosfolipas B-gener. Candida-arter som ofta orsakar sjukdomar har vanligtvis expansioner i dessa genfamiljer, så med tanke på att C. krusei sällan är patogen, detta fynd är vettigt.

När de fokuserade på gener involverade i läkemedelsresistens, gruppen fann att C. krusei skiljer sig från C. albicans; många av de platser som ofta är muterade i målet för azolläkemedel i resistenta C. albicans är inte muterade i C. krusei. Detta innebär att den kakaojäsande jästens naturliga resistens mot flukonazol härrör från en annan mekanism än den som vanligtvis tillåter C. albicans att motstå azolläkemedel.

Forskarna hittade inte heller genen MDR1, som kodar för en läkemedelstransportör som ofta är ansvarig för resistens mot flera läkemedel. Dom gjorde, dock, hitta kopior av gener relaterade till CDR1, CDR2, och få andra som kodar andra transportörer förknippade med läkemedelsresistens – även om hur de fungerar i C. krusei är okänt. Dessa gener kan vara en utgångspunkt för att upptäcka mekanismerna bakom antifungal resistens hos C. krusei, potentiellt leda till bättre behandlingar och förebyggande åtgärder för mycket utsatta befolkningsgrupper.