Ett internationellt team av forskare under ledning av University of Adelaide har publicerat hela genomet av vattenbuffeln – vilket öppnar vägen för förbättrad avel och bevarande av detta ekonomiskt viktiga djur.

Konsortiet av partners i Australien, Italien, Kina, Brasilien, och USA, med ytterligare bidragsgivare i andra länder, säger att de nu har skapat de verktyg som behövs för att tillämpa moderna molekylära avelssystem på vattenbufflar.

"Vattenbufflar tamdes för cirka 5000 år sedan, och har sedan dess varit av ekonomisk betydelse för mjölk, kött och som arbetsdjur runt om i världen, " säger konsortiets ledare professor John Williams, Direktör för University of Adelaides Davies Research Center på Roseworthy campus.

"De är särskilt viktiga i utvecklingsländer och, på specialiserade marknader, de tillhandahåller mjölk till produkter som mozzarellaost i Italien. Vattenbuffeln är ett viktigt jordbruksdjur eftersom den kan anpassa sig till olika miljöer, och är särskilt tolerant mot sjukdomar.

"I Australien, de fördes till Northern Territory i början av 1800-talet och idag finns det mjölkande besättningar av buffel i Northern Territory och i South Australia."

Det finns två underarter av vattenbuffel. Forskarna sekvenserade genomet av flodbuffeln, som har valts ut för mjölkproduktion genom organiserade avelsprogram i Italien, Indien, Filippinerna och Brasilien.

Professor Williams säger att sådana framsteg inom genomik har revolutionerat mjölkboskapsuppfödningen och nu kommer samma molekylära verktyg att finnas tillgängliga för vattenbuffeluppfödning. Detta projekt är ytterligare ett bra exempel på University of Adelaides djup och expertis inom forskningsområden relaterade till livsmedelsinnovation.

"Publiceringen av buffelgenomet utgör den väsentliga referenspunkten för studier av buffelens molekylära genetik, " Professor Williams säger. "Det kommer att hjälpa uppfödare att förbättra kommersiellt önskvärda egenskaper hos vattenbuffeln, och forskare och naturvårdare för att bevara mångfalden av buffelpopulationer."

Buffelgenomet har publicerats i tidskriften GigaScience .

Forskningssamarbetspartner och gemensam huvudförfattare Dr Daniela Iamartino, FoU teknisk chef vid AIA-LGS (Italienska uppfödarföreningen – Laboratory of Genetics and Services) i Italien, säger:"Det är också möjligt att jämföra buffelgenomet med det hos andra arter för att förstå skillnader i buffelns biologi och deras förmåga att anpassa sig till en mängd olika miljöer.

"Annoteringen av genomet identifierar generna som finns för att utforska deras funktion och studera skillnaderna mellan arter, " hon säger.

Konsortiet under ledning av professor Williams har också publicerat detaljer om ett specifikt molekylärt verktyg (kallat Buffalo SNP -chipet) i tidskriften PLOS ETT . Detta SNP -chip gör det möjligt för forskare och uppfödare att omsätta genomets sekvensinformation i praktiken. Gener som är involverade i viktiga egenskaper relaterade till produktion och sjukdom kan lokaliseras och användas för att uppskatta avelsvärdena för enskilda tjurar och kor.

"Detta kommer att erbjuda buffeluppfödare samma möjligheter för accelererat genetisk urval som nu används av nötkreatursuppfödare, säger professor Williams.