Skillnaden mellan histon och nonhistone är enkel. Båda är proteiner, båda ger struktur till DNA, och båda är komponenter i kromatin. Deras huvudsakliga skillnad ligger i den struktur de tillhandahåller. Histonproteiner är spolarna kring vilka DNA vindar, medan icke-histonproteiner tillhandahåller byggnadsstrukturen. Ett annat sätt att tänka på skillnaden är att nonhistone proteiner är de proteiner som finns kvar efter att alla histoner har tagits bort från kromatin.
Kromatin
Histoner är de viktigaste proteinkomponenterna för kromatin. Kromatin är ett "komplex av nukleinsyror (t.ex. DNA eller RNA) och proteiner (histoner) som kondenserar för att bilda en kromosom under celldelning." Tänk på kromatin som en vakuumförpackning som gör att en större mängd kläder passar snyggt in i en låda. Utan kromatin skulle en DNA-värds DNA värda sig till den ojämnliga längden på 1,8 meter! På toppen av förpackningen stärker kromatinet DNA så att det under celldelning (i antingen mitos eller meios) inte förlorar DNA-strukturen.
Histoner
Histoner är proteiner som ger en väsentlig struktur för DNA, vilket gör livet möjligt. Dessa proteiner fungerar som spolar om vilket DNA som vindas. En enskild cells värde av avlindat mänskligt kromosomalt DNA sträcker sig exempelvis omkring 1,8 meter. Tack vare histoner upptar det upplindade "komprimerade" DNA bara ca 90 millimeter utrymme. Utan histoner kunde DNA inte organisera sig i kromosomer, och livet som vi vet det skulle inte existera. "Vidare spelar histoner en roll i genreglering. Som en del av kromatin hjälper histoner till kontrollen av "expression" den process genom vilken kodad information i gener omvandlas till operativa strukturer i cellen.
Nonhistones
Enligt EverythingBio .com, en nonhistone är ett "protein kvar i chromatin efter att histonerna har tagits bort." Detta enkla uttalande gör inte rättvisa till den viktiga roll nonhistones spelar. Nonhistone proteiner innefattar byggnadsproteiner, heterokromatinprotein 1, DNA-polymeras och Polycomb och andra motorproteiner, vilka alla spelar viktiga roller i cellstruktur. I själva verket tillhandahåller nonhistones byggnadsstrukturen i DNA och kompletterar många andra strukturella och regulatoriska funktioner som gör livet möjligt.
Betydelse
Histoner kan inte fungera ensam. Histonproteiner kan endast fullborda sina funktioner i närvaro av nonhistone proteiner. Ändå skiljer sig histonproteiner från nonhistones, eftersom histonproteiner är mycket konserverade över arter, medan nonhistoner inte är. Med andra ord finns histonproteinerna som finns i en art typiskt i andra arter. Båda proteinerna är viktiga för biologi, båda finns i levande celler, båda ger struktur till DNA, men de sätt på vilka de fungerar skiljer sig avsevärt.