Bindning till specifika DNA-sekvenser (cis-regulatoriska element):
Transkriptionsfaktorer innehåller specifika DNA-bindande domäner som tillåter dem att känna igen och binda till korta DNA-sekvenser som kallas cis-regulatoriska element. Dessa element är lokaliserade i promotorregionerna av gener eller i förstärkarregioner som kan lokaliseras långt från genen.
Ändra kromatinstruktur:
När de väl är bundna till DNA kan transkriptionsfaktorer inducera förändringar i kromatinstrukturen, som är komplexet av DNA och proteiner som packar och reglerar DNA i kärnan. Transkriptionsfaktorer kan rekrytera kromatinombyggnadskomplex som modifierar histonproteiner, de grundläggande enheterna av kromatin. Dessa modifieringar kan lossa kromatinstrukturen, vilket gör den mer tillgänglig för transkription.
Rekrytering av koaktivatorer och RNA-polymeras:
Transkriptionsfaktorer kan rekrytera andra proteiner, kända som koaktivatorer, till promotorregionen. Koaktivatorer interagerar med transkriptionsfaktorer och hjälper till vid rekryteringen av RNA-polymeras, enzymet som ansvarar för att transkribera DNA till RNA. Genom att föra RNA-polymeras till promotorregionen underlättar transkriptionsfaktorer initieringen av gentranskription.
Interaktion med andra transkriptionsfaktorer och signalvägar:
Transkriptionsfaktorer fungerar ofta i samverkan med andra transkriptionsfaktorer och signalvägar för att reglera genuttryck. De kan bilda proteinkomplex eller interagera med signalmolekyler för att integrera olika cellulära signaler och modulera tillgängligheten för DNA för transkription.
Reglering av DNA-metylering och histonmodifieringar:
Vissa transkriptionsfaktorer kan också påverka DNA-metyleringsmönster och histonmodifieringar, som är ytterligare mekanismer som reglerar genuttryck genom att förändra kromatinstrukturen. Genom att kontrollera dessa epigenetiska modifieringar kan transkriptionsfaktorer ytterligare finjustera tillgängligheten för DNA för genuttryck.
Tillsammans tillåter dessa mekanismer masterregulatorer att kontrollera tillgängligheten för DNA och koordinera genuttrycksprogram som svar på olika cellulära signaler och miljösignaler.
