Proteinmålsökning är en komplex process som involverar ett antal olika faktorer, inklusive proteinets aminosyrasekvens, cellens membranstruktur och närvaron av specifika målsignaler.
Proteinets aminosyrasekvens bestämmer proteinets övergripande struktur och funktion. Den innehåller också information om proteinets målinriktning. Denna information kodas i form av specifika aminosyrasekvenser som kallas målsignaler.
Cellens membranstruktur spelar också en roll vid proteinmålsökning. Cellmembranet består av ett fosfolipiddubbelskikt som är ogenomträngligt för de flesta molekyler. För att komma in i cellen måste proteiner antingen transporteras genom membranet av ett specifikt transportprotein eller så måste de sättas in i själva membranet.
Närvaron av specifika målsignaler på proteinets aminosyrasekvens kan hjälpa till att styra proteinet till dess korrekta cellulära fack. Dessa signaler kan kännas igen av specifika receptorer på cellens membran eller i cytoplasman. När proteinet har blivit igenkänd av en receptor kan det transporteras till sin destination.
Proteininriktning är en kritisk process för att celler ska fungera korrekt. Genom att säkerställa att proteiner är placerade i rätt cellfack kan cellerna utföra sina väsentliga funktioner.
Här är några specifika exempel på hur proteiner riktas mot sina korrekta cellulära fack:
* Mitokondrier: Proteiner som är riktade mot mitokondrierna innehåller en specifik målinriktningssignal som kallas den mitokondriella målsekvensen (MTS). MTS känns igen av en receptor på mitokondriella membranet som kallas translokaset av det yttre membranet (TOM). TOM-komplexet transporterar sedan proteinet in i mitokondrierna.
* Endoplasmatiskt retikulum: Proteiner som är riktade mot det endoplasmatiska retikulumet (ER) innehåller en specifik målsignal som kallas signalpeptiden. Signalpeptiden känns igen av en receptor på ER-membranet som kallas signaligenkänningspartikeln (SRP). SRP-komplexet transporterar sedan proteinet till akuten.
* Lysosomer: Proteiner som är inriktade på lysosomer innehåller en specifik målinriktningssignal som kallas den lysosomala målsignalen (LTS). LTS känns igen av en receptor på det lysosomala membranet som kallas det lysosomassocierade membranproteinet 1 (LAMP-1). LAMP-1-komplexet transporterar sedan proteinet in i lysosomen.
Det här är bara några exempel på hur proteiner riktas mot sina korrekta cellulära fack. Processen för proteininriktning är avgörande för att celler ska fungera korrekt och är ett komplext forskningsområde.
