Adenin är en purinbas, och som sådan innehåller den följande funktionella grupper:

- Två aminogrupper (-NH2):En aminogrupp är belägen i position 6 i purinringen och den andra är belägen i position 1.

- En imidazolring:Imidazolringen är en femledad aromatisk heterocykel som innehåller två kväveatomer och en kolatom. Den är belägen vid positionerna 4, 5 och 7 i purinringen.

- En kol-kväve-dubbelbindning (C=N):Kol-kväve-dubbelbindningen är belägen mellan positionerna 8 och 9 i purinringen.