Saprofyter är organismer som får näringsämnen från dött eller ruttnande organiskt material. Detta inkluderar växter och svampar som bryter ner döda växt- och djurvävnader, samt bakterier och andra mikroorganismer som bryter ner organiskt material i mark och vatten. Saprofyter spelar en viktig roll i kretsloppet av näringsämnen i ekosystemen, och en del används också i produktionen av antibiotika och andra läkemedel.