Biologisk aktivitet kan förändra mängden vatten i atmosfären. Till exempel släpper växter ut vattenånga i atmosfären genom transpirationsprocessen. Denna vattenånga kan sedan kondensera och bilda moln och nederbörd. Dessutom kan biologisk aktivitet också påverka mängden vatten i marken. Till exempel kan växternas rötter hjälpa till att hålla vatten i jorden, medan daggmaskarnas och andra organismers aktiviteter kan hjälpa till att lufta jorden och förbättra dräneringen. Biologisk aktivitet kan också påverka mängden vatten i haven. Till exempel kan tillväxten av korallrev hjälpa till att skydda kustlinjer från erosion och stormskador.