Här är varför:
* synonyma mutationer är förändringar i DNA -sekvensen som inte förändrar aminosyrasekvensen för proteinet kodat av genen. Detta beror på att den genetiska koden är överflödig, vilket innebär att flera kodoner kan koda för samma aminosyra.
* icke-synonyma mutationer Ändra å andra sidan aminosyrasekvensen, som potentiellt kan förändra proteinets funktion och struktur.
* Insertions och borttagningar (Indels) kan orsaka ramförändringar, vilket leder till betydande förändringar i proteinsekvensen och kräver omfattande justering.
Eftersom synonyma mutationer inte ändrar proteinsekvensen har de minimal inverkan på genens övergripande struktur och funktion. Detta gör dem mindre benägna att störa anpassningen av homologa regioner över olika arter.
Därför skulle en synonym mutation minst kräva justering av homologa regioner i en gen som är gemensam för flera relaterade arter.
