* DNA -struktur: DNA är en dubbel spiral bestående av två antiparallella strängar. Den ena strängen kör 5 'till 3', och den andra kör 3 'till 5'.
* Endonucleases 'mål: Endonukleaser är enzymer som bryter fosfodiesterbindningarna inom en DNA -sträng. De har specifika igenkänningssajter, som är korta sekvenser av baser.
* Skärningens specificitet: Ett endonukleas kommer bara att klippa på sin erkännandeplats, oavsett DNA -strängens övergripande 5 'till 3'.
Här är ett förenklat exempel:
Föreställ dig att ett endonukleas känner igen sekvensen "Gaattc." Den kommer att skäras inom denna sekvens, oavsett om strängen den verkar på är 5 'till 3' strängen eller 3 'till 5' strängen.
Sammanfattningsvis: Endonukleaser skär inte "mellan" 5 "och 3" -ändarna av DNA -molekylen. De klipper * inom * strängen vid specifika sekvenser de känner igen. Deras verkan dikteras av bassekvensen och inte DNA -strängens riktning.