Medan serotonin ofta är förknippat med hjärnan och humöret, produceras det faktiskt i mycket större mängder i tarmen. Det spelar en avgörande roll för att reglera matsmältning, aptit och tarmmotilitet.
Det är dock viktigt att notera att hjärnan producerar också serotonin, men i mindre mängder jämfört med tarmen. Detta hjärn-härledda serotonin är involverat i humörreglering, sömn, aptit och andra kognitiva funktioner.