Det är viktigt att förstå att "Eubacteria" är en bred term som hänvisar till en stor och mångfaldig grupp bakterier. Det är inte korrekt att säga att Eubacteria som helhet har en specifik typ av symbiotisk relation.

Istället kan enskilda arter av eubakterier ha olika typer av symbiotiska relationer:

* Mutualism: Både bakterien och värden gynnas. Till exempel ger kvävefixerande bakterier i växtrötter kväve för växten, medan växten tillhandahåller en livsmiljö och näringsämnen för bakterierna.

* commensalism: En organisme gynnar, medan den andra varken skadas eller hjälpt. Till exempel lever vissa bakterier på vår hud utan att orsaka skada eller ge någon speciell fördel för oss.

* parasitism: En organisme gynnas på bekostnad av den andra. Till exempel orsakar patogena bakterier sjukdom i sina värdar.

För att bestämma vilken typ av symbiotisk relation som en specifik Eubacterium har, måste vi därför ta hänsyn till den specifika arten och dess interaktion med dess värdorganism.