Medan kärnmembranet i sig inte har en färg, är det ofta färgat med färgämnen i mikroskopi för att göra det synligt. Vanliga fläckar inkluderar:
* DAPI (4 ', 6-diamidino-2-fenylindol) :Denna fläck binder till DNA och fluoresces blått.
* propidiumjodid (PI) :Denna fläck binder också till DNA och fluoresces rött.
Så den uppenbara färgen av ett kärnmembran beror på färgningstekniken som används i mikroskopi.