* Brist på mitokondrier: Pelomyxa palustris är unik genom att den saknar mitokondrier, kraftverk från eukaryota celler. Detta har fått vissa att tro att det representerar ett tidigt skede i eukaryot utveckling. Det är emellertid mer troligt att Pelomyxa förlorade sina mitokondrier genom sekundär förlust, en process där en organisme förlorar en funktion som fanns i sina förfäder.
* Närvaro av bakterier: I stället för mitokondrier innehåller pelomyxa symbiotiska bakterier som utför många av de funktioner som mitokondrier brukar göra. Detta antyder att Pelomyxa utvecklade sitt unika energisystem efter förgrening från andra eukaryoter, inte förut.
* Evolutionär komplexitet: Eukaryoternas evolutionära historia är komplex och involverar flera linjer som förgrenar sig från en gemensam förfader. Det är svårt att identifiera en enda "mest primitiv" organism.
* Brist på ett definitivt "primitivt" tillstånd: Begreppet "primitivt" kan vara vilseledande. Organismer blir inte nödvändigtvis mer komplexa över tiden. Evolution är inte en linjär progression, utan en förgreningsprocess där olika linjer anpassar sig till sina miljöer på unika sätt.
Därför, medan Pelomyxa palustris verkligen är en intressant och unik organisme, är det inte nödvändigtvis den mest primitiva eukaryoten. Dess brist på mitokondrier kan vara en härledd egenskap, inte en primitiv.
I stället för att fokusera på "primitivitet" är det mer exakt att betrakta Pelomyxa som ett exempel på hur evolutionära processer kan leda till olika och fascinerande anpassningar, även i till synes enkla organismer.
