• Home
  • Kemi
  • Astronomien
  • Energi
  • Naturen
  • Biologi
  • Fysik
  • Elektronik
  •  Science >> Vetenskap >  >> Biologi
    Varför har du intervallet av koncentrationsagaros i gelelektrofores?
    Koncentrationen av agaros i ett gelelektroforesexperiment påverkar direkt storleken på porerna i gelmatrisen. Detta bestämmer i sin tur geléns upplösning, som hänvisar till dess förmåga att separera molekyler i olika storlekar.

    Här är en uppdelning av förhållandet mellan agaroskoncentration och gelegenskaper:

    Hög agaroskoncentration (t.ex. 2%):

    * små porer: En högre agaroskoncentration skapar en stramare gel med mindre porer. Detta är idealiskt för att separera mindre DNA -fragment (under 1000 bp) eftersom mindre molekyler lättare kan navigera i de trånga utrymmen.

    * högre upplösning: Mindre fragment kommer att migrera tydligare på grund av den mindre porstorleken, vilket resulterar i skarpare band.

    * långsammare migration: Molekyler måste pressa genom stramare utrymmen, vilket leder till långsammare migrationshastigheter.

    Låg agaroskoncentration (t.ex. 0,5%):

    * stora porer: En lägre agaroskoncentration skapar en lösare gel med större porer. Detta är idealiskt för att separera större DNA -fragment (över 10 000 bp) eftersom större molekyler lättare kan passera genom porerna.

    * lägre upplösning: Större fragment kanske inte är lika separerade på grund av den större porstorleken, vilket leder till mindre distinkta band.

    * snabbare migration: Större molekyler rör sig genom gelén snabbare på grund av mindre motstånd.

    Att välja rätt koncentration:

    Den ideala agaroskoncentrationen beror på storleken på molekylerna du vill separera:

    * små DNA -fragment: Använd en högre agaroskoncentration (1,5%-2%).

    * Stora DNA -fragment: Använd en lägre agaroskoncentration (0,5%-1%).

    * Allmänt syfte: En standardkoncentration av 1% används ofta för ett brett spektrum av DNA -fragment.

    Andra faktorer att tänka på:

    * Typ av agaros: Olika typer av agaros kan påverka porstorlek och upplösning.

    * buffert: Bufferten som används i elektrofores påverkar också migrationsgraden och upplösningen.

    * Elektriskt fält: Spänningen som appliceras över gelén kan också påverka migrationsgraden.

    Sammanfattningsvis är koncentrationen av agaros i gelelektrofores avgörande för att uppnå optimal upplösning och separering av DNA -fragment. Genom att noggrant välja lämplig agaroskoncentration kan du säkerställa effektiv separering av önskade molekyler.

    © Vetenskap https://sv.scienceaq.com