Linné utvecklade ett hierarkiskt klassificeringssystem baserat på delade fysiska egenskaper, som fortfarande används idag, men med modifieringar. Detta system innehåller sju huvudnivåer:
1. domän: Den bredaste kategorin (t.ex. bakterier, archaea, eukarya)
2. Kingdom: En stor grupp relaterade organismer (t.ex. Animalia, Plantae)
3. phylum: En grupp relaterade klasser (t.ex. Chordata)
4. klass: En grupp relaterade beställningar (t.ex. Mammalia)
5. Order: En grupp relaterade familjer (t.ex. primater)
6. Familj: En grupp relaterade släkter (t.ex. Hominidae)
7. Släkt: En grupp nära besläktade arter (t.ex. HOMO)
8. Arter: Den mest specifika nivån, en grupp organismer som kan blandas och producera bördiga avkommor (t.ex. Homo sapiens)
Medan Linnés system var banbrytande, har det uppdaterats och förfinats över tid med utvecklingen av ny teknik och upptäckter, särskilt inom områdena genetik och molekylärbiologi.