1. Enzymer:
* nukleaser: Dessa enzymer bryter ner DNA. Det finns två huvudtyper:
* dNases: Specifikt försämra DNA.
* rNases: Förnedra RNA, men kan också klyva DNA under vissa förhållanden.
* proteaser: Dessa enzymer bryter ner proteiner, som kan binda till DNA och göra det svårt att isolera.
2. Polymerer:
* polysackarider: Dessa kolhydrater kan bilda klibbiga geler som fångar DNA. Exempel inkluderar glykogen i djurceller och stärkelse i växtceller.
* proteiner: Som nämnts kan proteiner binda till DNA och hindra dess extraktion.
* lipider: Fetter och oljor kan störa DNA -utfällning och göra det svårt att ta bort från lösningen.
3. Andra cellulära komponenter:
* cellulosa och lignin: Dessa är strukturella komponenter i växtcellväggar och kan vara svåra att ta bort, vilket hindrar DNA -isolering.
* sekundära metaboliter: Dessa föreningar kan produceras av växter och djur och störa DNA -extraktion. Exempel inkluderar tanniner, alkaloider och pigment.
* salter: Höga koncentrationer av salter kan störa DNA -utfällning och hindra dess rening.
4. Kontaminering:
* mikrobiellt DNA: DNA från bakterier, svampar eller andra mikroorganismer kan förorena prover.
* Miljö -DNA: DNA från källor som jord, vatten eller luft kan också förorena prover.
För att hantera dessa utmaningar inkluderar DNA -extraktionsprotokoll ofta steg som:
* Lyse -celler: För att bryta upp cellmembranet och frigöra DNA.
* inaktivera enzymer: Genom värmebehandling, kemiska hämmare eller mekanisk störning.
* Ta bort störande ämnen: Genom filtrering, nederbörd eller andra metoder.
* rena DNA: Med hjälp av tekniker som etanolutfällning eller kolonnkromatografi.
Det är viktigt att överväga den specifika typen av cell och den avsedda applikationen när du väljer en lämplig DNA -extraktionsmetod.
