Bakterier har emellertid några unika strukturer som inte finns i eukaryota celler:
* plasmider: Små, cirkulära DNA -molekyler som bär extra gener.
* ribosomer: Dessa är involverade i proteinsyntes, men bakteriella ribosomer är mindre än eukaryota ribosomer.
* kapsel: Ett skyddande skikt utanför cellväggen, gjord av polysackarider.
* pili: Hårliknande bilagor som hjälper bakterier att fästa vid ytor.
* flagella: Svansliknande strukturer som används för rörelse.
Det är viktigt att komma ihåg att dessa strukturer inte tekniskt betraktas som "organeller" eftersom de inte är membranbundna. De är emellertid fortfarande viktiga för bakteriefunktion och överlevnad.