Det finns emellertid två huvudtyper av genetisk kartläggning:
* Länkkartläggning: Denna metod använder frekvensen av rekombination mellan gener för att bestämma deras relativa positioner på en kromosom. Det är baserat på idén att gener som är nära varandra på en kromosom är mindre benägna att separeras under meios, medan gener som är längre från varandra är mer benägna att separeras.
* Fysisk kartläggning: Denna metod bestämmer direkt den fysiska platsen för gener på en kromosom. Den använder tekniker som kloning och sekvensering för att skapa detaljerade kartor över kromosomen.
Så medan både koppling och fysisk kartläggning bidrar till att förstå arrangemanget av gener på en kromosom, genetisk kartläggning är paraplytermen för processen.
