1. Aminosyror:
* Proteiner består av kedjor av aminosyror . Det finns 20 olika aminosyror som vanligtvis finns i proteiner.
* Varje aminosyran har en central kolatom bunden till:
* en aminogrupp (-NH2)
* En karboxylgrupp (-COOH)
* En väteatom (-H)
* En sidokedja (R-grupp)
2. Peptidbindningar:
* Aminosyror kopplas samman via peptidbindningar . Dessa bindningar bildas mellan karboxylgruppen av en aminosyra och aminogruppen av en annan.
* Den resulterande kedjan kallas en polypeptid .
3. Nivåer av proteinstruktur:
* Primärstruktur: Detta är den linjära sekvensen av aminosyror i en polypeptidkedja. Det är som "alfabetet" hos proteinet.
* Sekundär struktur: Detta hänvisar till lokala, upprepande vikningsmönster i polypeptidkedjan. De två huvudtyperna är:
* alfa-helix: En spiralformad struktur stabiliserad av vätebindningar mellan aminosyror i kedjan.
* beta-ark: En platt, arkliknande struktur som bildas av vätebindningar mellan angränsande polypeptidsträngar.
* tertiär struktur: Detta är den övergripande tredimensionella formen för en enda polypeptidkedja. Det bestäms av interaktioner mellan R-grupperna av aminosyror, inklusive:
* vätebindning: Svaga attraktioner mellan polära grupper.
* jonisk bindning: Attraktioner mellan motsatt laddade grupper.
* hydrofoba interaktioner: Kluster av icke -polära grupper bort från vatten.
* disulfidbroar: Kovalenta bindningar mellan cysteinrester.
* kvartärstruktur: Detta hänvisar till arrangemanget av flera polypeptidkedjor (underenheter) i ett proteinkomplex. Denna strukturnivå finns endast i vissa proteiner.
4. Faktorer som påverkar proteinstrukturen:
* aminosyrasekvens: Sekvensen för aminosyror är den primära determinanten för proteinstrukturen.
* Miljöförhållanden: Faktorer som pH, temperatur och saltkoncentration kan påverka proteinvikning och stabilitet.
* chaperones: Proteiner som hjälper andra proteiner att vikas korrekt.
5. Betydelsen av proteinstruktur:
* Funktion: Den specifika formen på ett protein bestämmer dess funktion.
* Specificitet: Denna form tillåter proteiner att binda till specifika molekyler (t.ex. enzymer till substrat, antikroppar mot antigener).
* stabilitet: Korrekt vikning säkerställer proteinstabilitet och förhindrar felfoldning som kan leda till sjukdomar.
Sammanfattningsvis är proteiner komplexa molekyler med intrikata strukturer som gör att de kan utföra ett stort antal funktioner i cellen. Att förstå proteinstrukturen är avgörande för att förstå deras roller i biologiska processer.
