* membranbunden kärna: Bakterier är prokaryoter, vilket innebär att de saknar en membranbunden kärna. Deras DNA är beläget i en region som kallas nukleoiden, men det är inte inneslutet i ett membran.
* membranbundna organeller: Till skillnad från eukaryota celler saknar bakterier organeller som mitokondrier, Golgi -apparat, endoplasmatisk retikulum, lysosomer, etc. Alla dessa strukturer är inneslutna av membran, och bakterier har inte den inre avdelningsnivån.
* cytoskelett: Medan bakterier har vissa strukturella proteiner, har de inte det komplexa och organiserade cytoskelettet som finns i eukaryota celler. Detta cytoskelett ansvarar för att upprätthålla form, rörelse och intracellulär transport i eukaryoter.
* linjära kromosomer: Bakteriellt DNA är vanligtvis cirkulärt, inte linjärt som i eukaryota celler.
Det är viktigt att notera att även om dessa strukturer är frånvarande i typiska bakterieceller, finns det undantag. Vissa bakterier kan ha specialiserade strukturer som interna membransystem för att genomföra vissa metaboliska processer. Dessa är emellertid inte så komplexa eller lika utbredda som de membranbundna organellerna som finns i eukaryota celler.