Han anses vara far till taxonomi, vetenskapen om att klassificera organismer. Hans system, känt som Linnaean Taxonomy, använder ett hierarkiskt system för klassificering, med organismer grupperade i alltmer specifika kategorier:
* kungariket
* phylum
* klass
* order
* familj
* släktet
* arter
Linnés arbete var banbrytande för sin tid och lägger grunden för modern biologisk klassificering.