* Traditionell klassificering: Innan Darwin baserades klassificeringen främst på delade fysiska egenskaper. Organismer grupperades baserat på hur liknande de såg ut, oavsett deras evolutionära relationer. Detta var känt som Linnaean -systemet .
* Evolutionär klassificering: Darwins evolutionsteori introducerade begreppet vanlig härkomst. Detta innebar att organismer var relaterade genom delade förfäder. Biologer började fokusera på evolutionära relationer, inte bara ytliga likheter. Detta ledde till:
* fylogenetisk klassificering: Klassificeringssystem baserade på evolutionära relationer, använder verktyg som Cladistics för att avgöra hur organismer är relaterade. Detta är det dominerande systemet som används idag.
* betoning på förfäder: Klassificeringar blev mindre om godtyckliga kategorier och mer om att förstå historien och diversifieringen av livet.
* dynamiskt system: Evolutionär klassificering inser att klassificeringen inte är statisk. När nya upptäckter görs ändras förståelse för evolutionära relationer och klassificeringssystemen revideras i enlighet därmed.
I huvudsak förändrade evolutionsteorin fokus för klassificering från statiska grupperingar till en dynamisk, historisk ram som revolutionerade vår förståelse för mångfalden i livet på jorden.